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Skills

面向生命科学的开源 AI 技能合集——17 大类、240 个 Skill,每个都是写给 AI 助手的专业操作手册,让它按规范做对、给可复现结果、标清出处,也敢说「这里还不确定」。完全免费开源、克隆即用,也能直接在百沐一下平台上跑。

识别研究空白

进阶
从证据、方法、人群等五个角度扫出真正的研究空白,每条都附文献出处

构建研究问题

入门
用 PICO、FINER 把模糊想法收窄成能回答的研究问题,评审问不倒

构建可检验假设

进阶
把「可能有关」改写成方向明确、可证伪的假设,配好 H0 与 H1

构建概念框架

进阶
用 DAG 理清自变量、中介、混杂,画成变量关系图并列出待检验路径

选择研究设计

进阶
按您的因果问题和现实约束,选对研究设计,附对比表与主要局限

定义变量与研究结局

进阶
把每个结局定义到可测量、可复现,锁定主结局,理清主次层级

规划对照、重复、随机化与盲法

专家
排明对照、重复与盲法,生成随机分组表并固定种子,让实验可复现

预判设计阶段的偏倚与混杂

专家
设计阶段就前瞻性揪出选择、信息与混杂偏倚,给两套缓解策略

计算样本量与统计效能

专家
选对公式算样本量与效能,参数溯源、附可复现脚本和功效曲线

编写统计分析计划

专家
预先冻结一份完整 SAP,堵住 p-hacking,可直接用于预注册

规划预实验与可行性研究

进阶
让预实验回归验证可行性,定量化指标与 go/no-go 推进标准

编写与注册研究方案

专家
按 SPIRIT 搭全研究方案章节,推荐注册平台并附提交前自查清单

设计质性或混合方法研究

进阶
给质性或混合方法一套站得住的方案:抽样、编码框架与可信度论证

规划湿实验

进阶
把科学问题落成有对照、有重复的实验设计,做完真能回答问题

改编已发表实验方案

进阶
照论文做不出来?把原方案逐步搬到您的体系,标出必改点与风险

计算试剂、缓冲液与稀释

入门
配液与稀释一步算准,留下带公式的记录,好复核也好复现

管理样本与实验室元数据

入门
建一套可追溯的样本命名与元数据规范,从此不再张冠李戴

记录实验笔记与SOP

入门
把操作整理成可追溯的实验记录,把常做流程沉淀成标准 SOP

排查实验问题并开展质控

进阶
实验做砸别乱换试剂:按流程排出最可能的原因,再建质控关口

验证实验室方法

专家
按规范验准确度、精密度、线性与检出限,让方法数据经得起审

设计PCR与qPCR实验

进阶
设计特异、扩得出的 PCR/qPCR 引物,含二聚体与跨外显子核查

规划分子克隆

进阶
先在电脑里走通克隆策略,核对读框与位点,再给引物和验证方案

设计基因编辑实验

专家
从 sgRNA 选点到脱靶评估与基因型验证,把编辑实验整套设计好

规划核酸提取与质控

入门
按样本和下游选对核酸提取方案,定好防降解要点与质控合格线

规划测序文库制备

进阶
按测序目标把建库起始量、循环数到测序深度一次规划到位

规划细胞培养实验

入门
把细胞系核验、批次记录、支原体监控前置,让细胞实验可复现

规划转染与转导

进阶
把递送方式、MOI 与配比排成优化矩阵,少烧质粒病毒少走弯路

规划蛋白检测与定量

进阶
按目的选对 WB/ELISA/质谱,设好归一化,让定量数字站得住

规划蛋白表达与纯化

专家
一次设计好从构建到纯化的路线,避开不表达与包涵体的坑

规划酶学与生化实验

专家
把反应体系和取样落在线性初速度区,让 Km/Vmax 拟合真可信

规划流式细胞实验

进阶
一次配好荧光 panel、补偿与 FMO 对照,让每个群都门控有据

规划显微成像与免疫染色

进阶
把免疫染色与成像做成有对照、可定量的流程,让漂亮图经得起问

规划质谱实验

专家
把上机前的样本制备、酶切与对照重复设计成可复现的质谱方案

规划微生物实验

进阶
把培养、无菌操作与 CFU 计数、药敏设计得规范可重复

规划动物研究

专家
把动物实验设计成合伦理、样本量够、符合 ARRIVE 的方案

验证科研抗体

进阶
用 KO/KD 对照系统验证抗体特异性,早早填掉可重复性的坑

设计孔板布局与移液排布

进阶
把样本对照排成防边缘效应的孔板图,配可导入工作站的移液单

清洗与规整科研数据

入门
把杂乱的原始表整理成能直接分析的规整数据,附可复现清洗脚本

开展探索性数据分析

入门
建模前先把数据摸一遍:看清分布、缺失与异常,心里有底再动手

生成描述性统计与基线表

入门
一键生成规范的基线表(Table 1),统计量自动匹配、格式对齐期刊

选择并执行统计检验

进阶
按数据类型和设计选对统计检验,附效应量、置信区间与前提核查

分析相关与回归

进阶
正确建起相关与回归模型,做完残差诊断,把每个系数讲清楚

分析纵向与重复测量数据

专家
用混合效应模型处理重复测量与随访数据,分开个体差异和时间趋势

分析生存数据

专家
规范做生存分析:从 KM 曲线到 Cox 模型,删失与假设一步不落

处理缺失数据

进阶
先诊断数据为何缺失,再做多重插补加敏感性分析,避免引入偏倚

开展 Meta 分析

专家
规范合并多项研究效应,量化异质性、评估偏倚,出森林图与漏斗图

开展因果推断

专家
从观察数据审慎估计因果效应:用因果图理清路径,再匹配或加权

构建与验证预测模型

专家
把预测模型做到校准与内外部验证,防过拟合,按 TRIPOD 出报告

审核统计分析与结论

专家
像审稿人一样把关分析:定位统计问题、核查可复现性,给修改建议

设计与分析育种田间试验

专家
把田间试验设计做对,用混合模型剥离环境噪声,给可靠育种值

用经典机器学习分析生物数据

专家
在高维小样本生物数据上搭防泄漏建模管线,配交叉验证与 SHAP 解释

构建物种分布模型

专家
把物种分布模型做扎实:处理采样偏差、做空间交叉验证,给可信适生区

分析生态群落与物种记录

进阶
先洗净 occurrence 脏数据,再做多样性、排序与 PERMANOVA 分析

拟合剂量-反应与标准曲线

进阶
规范拟合剂量-响应曲线,出带 95%CI 的 IC50/EC50 与拟合诊断

分析问卷量表(信效度与因子分析)

进阶
把量表作答做成规范的信度、效度与因子分析,验证结构不只报 α

评估测量一致性与信度

进阶
按数据类型选对一致性指标,用 ICC、kappa 和 Bland-Altman 而非相关

处理生信文件格式与转换

入门
FASTQ/BAM/VCF/BED 无损互转,坐标系与命名自动对齐,附可复跑脚本

开展测序质控与预处理

入门
读懂测序质控报告,按文库类型给清洗方案,不把真信号削没

准备组学数据与元数据

入门
把表达矩阵和样本元数据对齐规范,交一份能直接分析的干净矩阵

组装与注释基因组

专家
从 reads 到注释基因组全流程编排,用 N50、BUSCO 硬指标评质量

构建可复现生信流程

进阶
把零散脚本重构成锁好环境、能一键复跑的标准流程

校正组学批次效应

进阶
先诊断批次强度再稳妥校正,保住真信号不抹掉真实差异

开展功能富集与通路分析

进阶
基因列表规范做成 GO/KEGG/GSEA,分清统计显著与生物学意义

分析序列变异

进阶
按最佳实践检测过滤 SNV/InDel,用质控指标判断 callset 可不可靠

分析拷贝数与结构变异

专家
多策略检测 CNV 与结构变异,去假阳并按证据强度给候选分级

分析长读长测序

专家
按 ONT 或 PacBio 选对方法,做 SV、甲基化或全长转录本分析

注释与排序遗传变异

专家
给 VCF 变异做功能注释,接多源证据把致病候选排到最前面

分析全基因组关联研究数据

专家
规范质控与分层校正跑 GWAS,教您从 QQ 图判断信号真假

分析群体遗传数据

专家
跑群体结构、分化与选择信号,提醒您别把统计显著讲成演化故事

开展系统发育分析

进阶
从比对到建树评估支持度,讲清每条分支到底可不可信

开展系统发育比较分析

专家
用 PGLS 等方法控制亲缘关系,避开跨物种回归的虚假相关

分析Bulk RNA测序数据

进阶
用 DESeq2/edgeR 走差异表达标准流程,让差异基因列表经得起推敲

分析可变剪接

专家
检测差异可变剪接事件,算 ΔPSI 并帮您避开极高的假阳性

分析共表达网络

进阶
找出协同表达的基因模块与枢纽基因,看它们与表型的关系

分析单细胞RNA测序数据

入门
原始矩阵一路跑到降维聚类,阈值、种子、版本全留档可复现

注释单细胞类型

进阶
为每个 cluster 搭一条可审核的证据链,注出细胞类型和置信度

分析单细胞轨迹与RNA速率

专家
跑伪时序与 RNA 速率,讲透箭头方向可能是假象、别当定论

分析细胞间通讯

进阶
跨方法取共识推断配受体通讯,给一份待湿实验验证的候选清单

分析单细胞ATAC与Multiome数据

专家
把 scATAC/Multiome 跑成可及性与调控图谱,每步 QC 决策留档

分析空间组学数据

专家
按平台正确读入并对齐组织图像,把分析真正做在空间维度上

分析染色质可及性与结合

进阶
ATAC/ChIP/CUT&RUN 一条龙 call peak,附 FRiP、IDR 让结果站得住

分析DNA甲基化数据

专家
按芯片或测序平台走对应流程,把 DMP/DMR 差异甲基化做扎实

分析三维基因组

专家
Hi-C 建矩阵到 TAD/loop 调用成套,按覆盖度帮您选合适分辨率

分析蛋白质组数据

进阶
从定量矩阵到差异蛋白全程做完,缺失填补与批次校正都讲清假设

分析代谢组与脂质组数据

进阶
用 QC 样本校正漂移,按 MSI 等级如实标注代谢物鉴定置信度

分析微生物组与宏基因组数据

进阶
用组成感知方法做多样性与差异丰度,让菌群结论站得住、可复现

分析免疫组库

进阶
标准化 TCR/BCR 克隆定义,深度归一化让多样性对比真正可比

整合多组学与生物网络

专家
先对齐跨组学 ID 与尺度,用 MOFA/DIABLO 整合找出共通信号

分析植物基因组

专家
按倍性与杂合度调参,把多倍体植物基因组的变异检测做对

比对reads并定量表达(reads→counts)

进阶
从 clean reads 到 counts 矩阵,核验易翻车处,交来路清楚的矩阵

构建公共组学预后模型与基因标签

专家
用公共数据走 LASSO-Cox 建预后模型,跨队列外部验证经得起审计

获取与评估蛋白质结构

入门
一次捞齐候选结构并逐条评质量,告诉您哪条链、哪段残基能用

预测蛋白质及复合物结构

进阶
按目标挑对预测工具跑出结构,把置信度和不可靠区段讲清楚

比较与可视化蛋白质结构

进阶
把多套结构叠好、算清差异在哪,出一张能进论文的比对图

检测结合口袋并分析相互作用

进阶
找出并排序候选口袋,把氢键、盐桥等相互作用梳成图和表

开展分子对接

进阶
规范预处理受体配体跑对接,冷静说清打分能与不能说明什么

设计虚拟筛选流程

专家
把虚拟筛选设计成分层漏斗,算力花在刀刃上,还能看富集

分析分子动力学与自由能

专家
规范建 MD、盯住收敛,估结合自由能并老实报误差与边界

处理分子并计算描述符

入门
把一批分子标准化干净,再批量算好描述符和指纹,附可复现代码

分析构效关系

进阶
用匹配分子对讲清构效关系,揪出结构近似、活性断崖的关键对

排序药物靶点并评估可成药性

进阶
把散落的多维证据汇总打分,再评一评靶点能不能成药

评估类药性与 ADMET

进阶
按项目阶段预筛类药性和 ADMET 风险,出一张带分级的风险表

设计蛋白质序列

专家
对固定骨架反向设计序列,用结构预测回测可折叠性再进实验

准备可建模的蛋白结构

进阶
把原始结构清洗补全、加氢,产出能直接进对接与模拟的结构

构建中药网络药理学分析工作流

进阶
把中药方剂串成可复现的成分-靶点-疾病-通路网络分析

构建PICO并评估临床证据

进阶
把模糊的临床问题拆成 PICO,配好检索式,按 GRADE 讲清证据有多强

检索临床试验(含注册库查询)

入门
给关键词和纳排条件,跨注册库去重拉取,产出可复现的临床试验清单

设计临床试验方案

专家
按 SPIRIT 搭全方案骨架,样本量算出来,随机盲法结局成体系

分析临床试验

进阶
该用 ITT 还是 PP、配什么模型,按 CONSORT 规范跑出结果与图

定义队列并分析电子健康记录

专家
从 EHR 写出可复现队列定义,做基线表并校正混杂算关联

评估诊断试验

进阶
不止敏感度特异度:算全套带 CI 指标、画 ROC,按 STARD 查偏倚

开展临床Meta分析

进阶
按 PRISMA 合并效应量,评异质性与发表偏倚,出森林图和 GRADE 表

开展网络Meta分析

专家
建治疗网络合成直接与间接证据,出联赛表和 SUCRA 排序

设计真实世界证据研究

专家
用目标试验模拟避开不朽时间偏倚,把真实世界研究设计做扎实

构建临床预测模型

专家
按 TRIPOD 建预测模型,兼顾区分度、校准与内外部验证

评估药物警戒数据

进阶
从 FAERS 抽报告,算 PRR/ROR 等指标,排出候选安全信号

分析公共卫生监测数据

进阶
给监测数据去季节化看趋势,用 CUSUM/EARS 早发现异常升高

分析暴发调查数据

专家
从病例线列表画流行曲线,估 Rt、拟合 SEIR 做情景预测

评估健康公平性

进阶
把人群健康差距量化:绝对差、相对差与 SII/RII 集中指数

分类临床遗传变异

专家
跨库查齐证据,按 ACMG/AMP 逐条判定,给可追溯的五级致病分类

解读药物基因组学证据

进阶
从基因型推代谢表型,按 CPIC/DPWG 给用药建议和证据等级

评估临床指南与转化证据

进阶
把多部指南推荐结构化对比,评方法学质量,列出转化落地缺口

评估成本效果与卫生经济学

专家
建决策树或马尔可夫模型算 ICER,做敏感性分析,按 CHEERS 报告

开展两样本孟德尔随机化因果推断

专家
用公开 GWAS 跑两样本 MR:从工具变量到多效性质控与三张图

撰写科研论文

进阶
把手里的方法与图表搭成 IMRaD 论文初稿,理清能说服人的论证链

编辑科学语言

入门
逐句把英文改地道、去掉 AI 腔,凡可能动原意处都标出请您定夺

核验论文论断与引用

进阶
逐条核对每处引用是否真实、是否真支持论断,揪出编造的 DOI

评审科研论文

专家
按同行评审标准替您系统过稿,分 major 与 minor 定位到具体段落

回复同行评审意见

进阶
把审稿意见逐条拆成标准回复信,该改的说清、该驳的据理反驳

选择期刊并准备投稿

进阶
按稿件匹配候选期刊并排序,备齐投稿清单与 cover letter 草稿

制作科研海报

入门
把长论文重构成看得进去的海报,提炼一句核心信息、规划阅读动线

制作科研汇报

入门
把成果编排成有叙事的幻灯片,每页收敛到一个要点,还配演讲备注

制作图文摘要与传播内容

进阶
把论文浓缩成一条可视化主线,产出图形摘要脚本与分渠道传播文案

准备中文学位论文与参考文献

进阶
按学校规范搭学位论文结构,参考文献套 GB/T 7714 著录并附核查表

准备中文期刊投稿与合规检查

进阶
按中文期刊投稿须知备齐材料与各类声明,过一遍合规自查标出红线

撰写临床病例报告

进阶
把病例对照 CARE 清单搭成规范报告骨架,附去标识与伦理核对表

学位论文改写为期刊论文

进阶
把学位论文核心章拆成 IMRaD 期刊稿,标明该删该压,盯住重复发表红线

分析生物医药产业与技术

进阶
把 ADC、mRNA 等新模态拉成一张带出处、分成熟度的赛道全景图

编制目标产品概况

进阶
按目标标签搭起 TPP 与 QTPP,让研发、临床、注册对齐一个产品目标

分析竞争研发管线

进阶
把散在各库的竞品管线去重成可比表,帮您找到差异化白空间

评估专利格局

专家
摸清某靶点被谁占坑、有没有雷,出可复现的专利格局与 FTO 信号

准备法规情报

进阶
按产品、市场、阶段锁定适用法规,出三地差异对照与变化提示

规划注册申报资料

进阶
按 CTD/eCTD 搭到小节的申报目录,标清供稿职能、缺口与关键路径

编写SOP并管理受控文件

进阶
起草照着做得出来的 SOP,把版本、审批、作废整套受控文件搭起来

调查偏差并制定CAPA

进阶
用 5Why、鱼骨图把 GMP 偏差查到根因,产出可闭环的 CAPA 计划

评估GxP准备度

专家
逐条自查离 GxP 还差多少,给条款依据、风险分级与分期整改路线图

设计受监管检测方法验证

专家
按 ICH 与药典设计合规的方法验证方案与接受标准,附可跑统计脚本

评估生产质量控制数据

进阶
自动核对批 QC 数据、画控制图、标注 OOS/OOT 与跨批漂移,附脚本

准备技术转移

专家
把散在人脑的工艺知识搭成技术转移包,含 CPP/CQA 对照与风险评估

医学事务循证简报

进阶
把散落临床证据拢成带 GRADE 分级的循证简报,守住非推广红线

科学尽职调查

专家
独立核验标的的科学主张,出分级红旗清单与管理层澄清问题

临床前研发全景图

进阶
打通 Open Targets、ChEMBL 等三库,拼出临床前全景并定位靶点白空间

药物警戒与安全性报告

专家
起草 ICSR、PBRER/DSUR 骨架与加急时限判定表,跟上多国上报义务

审评发补答复起草

进阶
把审评发补问题逐条拆解、回溯到 CTD 出处,出带溯源的四段答复骨架