组装与注释基因组
Assemble and Annotate Genomes · 🔴专家 · 所属分类：组学与生物信息分析
从 reads 拼出基因组，工具链长、参数敏感、还特别吃算力，拼完还得判断组装质量到底行不行、注释可不可信，新手常常不知从哪下手。它帮你把从数据到注释基因组的整条流程编排起来，并用硬指标评估质量，让你心里有数。
适合谁
要给非模式物种做从头组装、缺乏成熟流程经验的研究生和研究者。
给它什么 · 得到什么
- 你提供：测序 reads（二代/三代/混合）、物种与预估基因组大小、倍性、有的话附参考或近缘物种、你的算力环境
- 你得到：组装草图（FASTA），加质量评估报告（N50/BUSCO/QUAST），加结构与功能注释（GFF3）及流程脚本与参数记录
怎么用
示例提问：「我有一批某昆虫的 PacBio HiFi 加二代 reads，基因组大概 300Mb、二倍体，帮我规划组装和注释流程，并说清怎么判断拼得好不好。」 触发后它会按数据类型选组装策略、用 BUSCO/QUAST/Merqury 评估完整性与准确性，再编排结构和功能注释，并记录版本参数产出可复现骨架。
提个醒
它本质是编排专业组装工具加解读，重算力步骤要在外部集群跑；组装质量结论以评估指标为准，不夸大。