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解析与映射生物学标识符

Resolve and Map Biological Identifiers · 🟢入门 · 所属分类:科学数据库与知识发现

一张表里的基因名常常 Symbol、Entrez、Ensembl、UniProt 混着来,还夹着过时别名和物种混淆,手工对照极容易张冠李戴,下游分析跟着全错。它帮你把这些乱七八糟的 ID 统一映射到同一个命名空间,该唯一的给你唯一,有歧义的明确标出来。

适合谁

需要把多来源基因/蛋白表格整合到一起的研究生、生信工程师,或做 meta 分析的科研人。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:一列或一张带 ID 的表(基因 Symbol / Ensembl / Entrez / UniProt / RefSeq),写明物种和来源库;也可以直接粘一段含 ID 的文字
  • 你得到:一张「原 ID → 目标 ID」对照表,标好置信度、一对多与歧义、映射不上的清单及原因,并附所用 ID 版本和查询时间

怎么用

示例提问:「我这张差异表达表里的基因名混着 Symbol 和 Ensembl,帮我全部统一成 UniProt AC,物种是小鼠。」触发后它会先判断每个 ID 的命名空间与物种、标出退役别名,再调用跨库映射连接器逐一转换,最后把歧义项和无法映射项单独列给你核对。

提个醒

映射结果依赖外部数据库版本,它会记录 ID 版本和查询时间;遇到一对多的歧义会明确标注,不会替你悄悄挑一个。