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整合多组学与生物网络

Integrate Multi-Omics and Biological Networks · 🔴专家 · 所属分类:组学与生物信息分析

各组学分开做完往往拼不到一起——ID 体系不通、尺度不一,硬叠加就容易得出虚假关联,网络分析也常缺乏统计支撑。它帮你把跨组学的 ID 和尺度先对齐,再用 MOFA/DIABLO 这类方法做因子/判别整合或相关网络,接入 STRING/Reactome 做网络与通路富集,并把整合方法的局限如实写清楚,帮你找到多组学间的共通信号。

适合谁

同时手握转录、蛋白、代谢等两套以上组学、想做整合分析的研究生和 PI。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:两套及以上组学的结果/矩阵(如转录+蛋白+代谢)、共同样本或基因/蛋白 ID、整合目标(共变/调控/通路)
  • 你得到:整合结果(共变模块/多组学因子/富集通路)+ 生物网络图 + ID 映射与整合方法及局限说明

怎么用

示例提问:「我有同一批样本的转录组和代谢组矩阵,想用 MOFA 找跨组学的共变因子,再把关键分子映射到 Reactome 通路做网络。」触发后它会先统一基因/蛋白/代谢物的 ID 映射和数据尺度,用 MOFA/DIABLO 做因子或判别整合,接入 STRING/Reactome 做网络与富集,给你整合结果表、网络图和方法局限说明。

提个醒

整合发现的关联是假设而非因果;ID 映射不完整会引入偏差,它会披露映射率让你心里有数。