分析代谢组与脂质组数据

Analyze Metabolomics and Lipidomics · 🟡进阶 · 所属分类：组学与生物信息分析

代谢组的峰表批次漂移严重、缺失和零值多，靶向和非靶向流程还不一样，代谢物鉴定的置信度参差不齐，一不小心就把噪声当成了生物学差异。它用 QC 样本帮你校正漂移、过滤信号，做归一化、多元和单变量分析，并按 MSI 等级如实标注每个代谢物的鉴定置信度，让你的差异代谢物和通路结论更可信。

适合谁

做代谢组、脂质组的研究生和 PI，手上有峰强度矩阵、想做差异和通路分析的人。

给它什么 · 得到什么

• 你提供：峰强度矩阵（XCMS/MZmine 输出或平台报告）、样本分组与 QC 样本、平台和靶向/非靶向类型、鉴定置信等级
• 你得到：带鉴定置信度的差异代谢物/脂质结果表 + 校正与归一化说明 + PCA/火山图和通路富集结果

怎么用

示例提问：「这是非靶向 LC-MS 的峰表，带 QC 样本，两组各 8 例，帮我做批次漂移校正、PLS-DA 和差异代谢物筛选，再做 MetaboAnalyst 通路富集。」触发后它会先用 QC 样本校正漂移、处理缺失和零值，做归一化与 PCA/PLS-DA，按置信等级标注代谢物，再做通路富集并给出质控说明。

提个醒

代谢物鉴定必须标注置信等级，非靶向的暂定鉴定不能当确证；PLS-DA 也容易过拟合，需要做交叉验证。