设计孔板布局与移液排布
Design Plate Layout and Liquid Handling · 🟡进阶 · 所属分类:实验室研究与实验方法
在 Excel 里手画 96/384 孔板图,对照标准品随手摆、同组样本扎堆或全压在易蒸发的边缘孔,多块板之间又不随机化,批次和位置效应就悄悄混进来;加样时照着乱图手吸还极易错孔漏孔。它帮你把样本和对照排成防边缘效应、可随机化的孔板图,再配一份可复现、能导入工作站的移液 worklist。
适合谁
做 96/384 板式实验、要跨板或上液体工作站的研究生、筛选和生信实验工程师。
给它什么 · 得到什么
- 你提供:孔板规格(孔数、单孔最大体积与死体积)、样本清单(数量/分组/重复数)、需要的对照/标准品/空白类型与数量、是否跨板与批次随机化需求、加样方式(手工或 Opentrons/Tecan/Hamilton/Echo 等型号),以及随机种子偏好。
- 你得到:一套孔板布局包——机器可读的板图 CSV 长表、带图例标色的可视化孔板网格图、source→destination 的移液 worklist,外加固定种子的可复现布局/随机化脚本和孔容、死体积核对与上样前检查清单。
怎么用
可以说:「我有 60 个样本、3 个重复要分到两块 96 孔板上,还有标准品和空白,帮我排一个防边缘效应、板间随机化的布局,并生成 Opentrons 的移液 worklist。」它会规划对照、标准品、空白和样本的孔位、避免同组聚集,用护孔留边或边缘随机化缓解蒸发和位置效应,按孔数把样本拆到多块板并做固定种子的板内/板间随机化,输出 CSV 长表、可视化网格和 source→destination 的移液体积,还会核对单孔最大体积、死体积与移液步数并给出上样前核查清单。
提个醒
板图和随机化由 wellmap/plater/Opentrons 等工具按固定种子生成,它只做编排配置和质控、不徒手臆排孔位;生成的 worklist 要按你实际工作站的导入规范再校验一遍,它不联机驱动机器;重复数是否统计充分交给 plan-controls/样本量 skill,浓度稀释体积交给 calculate-reagents,孔容与死体积可行性以你设备实测为准。