追踪细胞与生物对象

Track Cells and Biological Objects · 🔴专家 · 所属分类：生物成像与图像分析

延时成像里细胞会分裂、交错、进出视野，手动连轨迹几乎不可能，自动追踪又常断轨、错连，速度和迁移统计跟着失真。它帮你编排追踪工具、按运动尺度配参，把逐帧影像还原成细胞轨迹和运动学指标，并给出叠加动图让你人工核轨。

适合谁

做细胞迁移、活细胞延时成像、颗粒或细胞器运动分析的研究生和博后。

给它什么 · 得到什么

• 你提供：时间序列影像（注明帧间隔 Δt、像素尺寸 μm、通道）或已有的逐帧分割掩膜、追踪对象（单细胞/细胞器/颗粒）、预期运动尺度和是否有分裂事件。
• 你得到：轨迹表（每对象每帧坐标与 ID）、运动学指标汇总（速度、位移、方向性、MSD）、轨迹叠加图或动图，以及 TrackMate 可复现设置文件。

怎么用

先抛一句示例提问：「我有一段 30 分钟、每 2 分钟一帧的划痕实验延时影像，像素 0.65μm，想统计每个细胞的迁移速度和方向性，帮我用 TrackMate 追踪并导出轨迹。」触发后它会用 TrackMate/Fiji 做点检测与帧间连接、按运动尺度设定连接距离和间隙闭合、标记断轨错连与谱系分裂，再算速度/位移/方向性/MSD 并导出叠加可视化。

提个醒

它封装 TrackMate 等工具，链接质量取决于帧率与信噪比；断轨、错连需要人工核轨，轨迹统计要报告追踪参数和漏检率。