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分析暴发调查数据

Investigate Outbreak Data · 🔴专家 · 所属分类:临床研究与公共卫生

疫情刚起、手里只有一份还在滚动更新的病例线列表,你既得赶紧画出流行曲线看清趋势,又被追着问「R0是多少、还要传多久」。它把这套流行病学建模的活儿串起来——从整理线列表、画三间分布,到估计有效再生数Rt、拟合SIR/SEIR做情景预测,帮你在数据不全时也能给出带不确定区间的判断。

适合谁

疾控中心流调人员、传染病防控研究者,以及做暴发分析的公共卫生研究生。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:病例线列表(发病/报告日期、暴露、地点、人口学)或聚合病例计数,加上潜伏期/序列间隔的假设;有接触追踪或干预时间点更好。
  • 你得到:流行曲线与三间分布图、Rt估计及不确定区间、SIR/SEIR拟合与情景预测,还有关键参数假设的敏感性说明。

怎么用

先给一句示例提问,比如「这是某地一起诺如聚集性疫情的病例线列表,帮我画流行曲线、估计Rt,并预测两周后的病例走势」。触发后它会带你确认潜伏期/序列间隔假设,整理数据画图,用EpiEstim等估计Rt,再拟合仓室模型跑情景,并逐条标出敏感的参数。

提个醒

它做的是动力学建模的编排与解读,早期数据不确定性大,参数和预测都会标明假设,不替代现场流调的判断与决策。