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规划核酸提取与质控

Plan Nucleic Acid Extraction and Quality Control · 🟢入门 · 所属分类:实验室研究与实验方法

提取方法跟样本、下游对不上,得率低、核酸降解或带抑制物,常常做到建库或 qPCR 才发现 RNA 已经降解、A260/280 不合格,前面全白干。它帮你按样本类型和下游用途选对提取方案,把防降解、去抑制物的要点和质控标准都定清楚。

适合谁

第一次做核酸提取的本科生、要为下游测序把好起始质量关的研究生和技术员。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:样本类型和状态(组织/血/FFPE/环境/微生物等)、目标核酸(gDNA/total RNA/mRNA/small RNA/cfDNA)、下游用途、样本量和设备、是否担心降解或抑制物
  • 你得到:一份提取与 QC 方案——推荐方法/试剂盒类型和理由、关键步骤与防降解/去抑制物要点、得率和纯度/完整性的 QC 指标(A260/280、A260/230、RIN/DIN、片段分布)及合格阈值,外加一张送样前 QC 检查表

怎么用

比如:「我要从 FFPE 组织切片里提 total RNA 做转录组,担心降解严重,帮我选提取方案并定送样前的 QC 标准。」 它会按样本和目标核酸匹配裂解纯化策略、针对降解和抑制物给防护要点、定出得率纯度完整性的指标阈值,并给出送样前检查表。

提个醒

QC 阈值会随下游平台不同而变,要以对应建库/测序供应商的要求为准;涉及感染性样本会提醒你按生物安全等级操作,它也不替代试剂盒官方说明书。