查询蛋白质序列与结构域数据库
Query Protein Sequence and Domain Databases · 🟡进阶 · 所属分类：科学数据库与知识发现
想搞清一个蛋白有哪些功能结构域、有没有实验结构或 AlphaFold 模型、置信度多少，这些信息散在 UniProt、InterPro、PDB、AFDB 各处，拼不成完整画像。它帮你把它们汇成一份从序列到结构的完整蛋白档案。
适合谁
做结构功能分析、位点标注，或蛋白建模前期调研的研究生与结构/生信研究者。
给它什么 · 得到什么
- 你提供：蛋白标识（UniProt AC/名称、基因名+物种，或 PDB ID），要取的内容（序列/结构域/PTM 位点/结构模型/配体），可选残基区间
- 你得到：蛋白档案——FASTA 序列、结构域/家族注释表、功能位点与 PTM 列表、可用结构清单（PDB 分辨率、AlphaFold pLDDT 区间），附来源与版本
怎么用
示例提问：「帮我查 BRCA1 有哪些功能结构域，有没有实验结构或 AlphaFold 模型，各自置信度怎么样。」触发后它会从各库取规范序列、结构域、功能位点，汇总实验结构与预测模型，并标出 pLDDT 置信区间提示哪些区域别过度解读。
提个醒
AlphaFold 是预测模型，它会随附 pLDDT 置信度并和实验结构区分开；低置信/无序区不能当作确证结构来解读。