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开展功能富集与通路分析

Perform Functional Enrichment and Pathway Analysis · 🟡进阶 · 所属分类:组学与生物信息分析

一份差异基因列表,背景基因选错、多重检验不校正、只盯 p 值不看效应,富集结果就很容易被过度解读甚至带偏结论。它帮你把基因列表规范地转成 GO/KEGG/GSEA 通路结果,并告诉你哪些是统计显著、哪些才真有生物学意义。

适合谁

手握差异基因、想做通路解读又怕踩富集分析坑的研究生和研究者。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:基因列表或带统计量的排序表(如 DEG 及 logFC)、物种、基因 ID 类型、有的话附自定义背景集
  • 你得到:富集结果表(通路/GO 项加校正 p 加富集分数)、可视化(气泡/GSEA/网络图)及方法学与解读说明

怎么用

示例提问:「这是我一组上调的 DEG,人的 Ensembl ID,帮我做 GO 和 KEGG 富集,背景该怎么选、结果里哪些通路可信别过度解读。」 触发后它会规范 ID 映射、选合适背景做 ORA 或 GSEA、正确做多重检验校正,再对结果去冗余并区分统计显著与生物学意义。

提个醒

富集是探索性的假设生成,不等于因果或机制证明;它不会为凑显著去挑库或含糊 ID 版本。