分析可变剪接

Analyze Alternative Splicing · 🔴专家 · 所属分类：组学与生物信息分析

基因层面看着没差异，变化其实藏在剪接层面。它帮你检测并解读差异可变剪接事件，按事件类型分类、算ΔPSI和统计量，并把这类分析特别高的假阳性和对注释、覆盖度的依赖讲清楚，不让你被漂亮的候选骗过去。

适合谁

关注剪接调控的研究生与PI、做RBP或疾病转录组、发现基因差异表达讲不通故事的研究者。

给它什么 · 得到什么

• 你提供：比对BAM或转录本定量、参考注释（GTF）、样本分组设计，以及测序类型（短/长读长）与链特异性
• 你得到：差异剪接事件表（事件类型 + ΔPSI + 统计量）、sashimi/PSI可视化，以及方法与过滤说明

怎么用

描述你的数据和困惑，比如：

「我有敲低组和对照的RNA-seq BAM，基因层面差异不明显，想看看是不是剪接层面出了变化。」 触发后它会帮你在事件级（如rMATS）和isoform级策略间选择并说明前提，计算PSI、做组间差异与多重校正，按SE/A5SS/A3SS/RI/MXE分类解读，再用sashimi图帮你目视验证候选。

提个醒

剪接结论受注释完整性和覆盖度限制，关键事件它会建议你用RT-PCR等正交手段验证，通用红线适用。