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制作批量组学与表达图表

Create Bulk Omics and Expression Figures · 🟡进阶 · 所属分类:科研可视化

火山图阈值随手设、热图不标聚类和标准化、富集气泡图指标混乱——组学图看着漂亮却常常不可复现,还容易被质疑是挑着好看的画。它帮你把差异表达和富集结果画成规范的组学图,把阈值、多重检验校正、标准化方式都明明白白标在图上。

适合谁

做转录组/差异表达和富集分析、要出图汇报或投稿的研究生和生信入门者。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:差异表达结果表(基因/log2FC/p 或 adj.p)、表达矩阵(counts/TPM/归一化值)、样本分组,以及富集分析输出(GO/KEGG term + 统计量),并注明阈值
  • 你得到:组学专用图和可复现代码——火山图、表达热图(标注聚类/标准化)、富集气泡/条形图、可选曼哈顿图,图上明确写清阈值、校正与标准化方法

怎么用

示例提问,比如「这是我的 DESeq2 结果和 TPM 矩阵,帮我画火山图和 top50 差异基因热图,火山图标上 log2FC>1、adj.p<0.05 的阈值」。触发后它会画火山图并显式标注 log2FC 与校正后 p 阈值,做热图并注明 z-score 标准化和聚类方法,出富集气泡/条形图展示 count、GeneRatio 与校正 p,并把筛选阈值固化进图注保证可复现。

提个醒

阈值和校正方法会显式标注、前后一致;上游差异/富集分析对不对得靠你自己把关,它只负责如实呈现你给的结果。