预测蛋白质及复合物结构

Predict Protein and Complex Structures · 🟡进阶 · 所属分类：结构生物学与药物发现

AF2、ESMFold、Boltz、Chai 各有各的适用场景和算力代价，选谁、参数怎么设、复合物界面到底可不可信，新手很容易懵。它帮你按目标挑对工具、备好输入把结构跑出来，再把置信度掰开讲清楚，哪段不可靠也直接标给你。

适合谁

需要单体或复合物结构、但没时间逐个去踩各家预测工具坑的研究生和计算研究者。

给它什么 · 得到什么

• 你提供：序列 FASTA（单体或多链，注明化学计量）、是否含配体/核酸、精度-速度取舍与 GPU/时限约束
• 你得到：预测结构（PDB/mmCIF）、置信度报告（pLDDT/PAE/ipTM/界面评分），外加工具版本与参数记录，方便复现

怎么用

先来一句示例提问：「我有一对抗体重轻链序列想预测复合物界面，帮我选工具跑一下并评估界面可信度。」触发后它会按你的目标推荐 AF2/OpenFold3/ESMFold/Boltz/Chai，准备 MSA 和多链输入、管理化学计量，记录随机种与参数，最后解读置信度并圈出不可靠界面。

提个醒

这类预测吃算力/GPU，本质是编排预测工具再做解读；预测不等于实验验证，复合物界面尤其要谨慎，不承诺定量准确。