制作通路、网络与科学示意图
Create Pathway, Network, and Scientific Schematics · 🟡进阶 · 所属分类:科研可视化
STRING 网络画出来一团毛球、通路图节点标识不规范、机制示意图靠 PPT 拼贴——关系型和概念型的图最难做到既准确又清爽。它帮你把通路、互作网络和机制示意图画得有布局、有层次、有图例,节点用标准标识,读者一眼看得懂。
适合谁
要在文章或汇报里放互作网络、通路富集图或机制示意图的研究生和研究者。
给它什么 · 得到什么
- 你提供:网络的节点与边列表(基因/蛋白/关系及权重)、通路来源(Reactome/KEGG/STRING ID 或查询基因集)、示意图要表达的机制流程与实体清单
- 你得到:关系与概念图及可复现代码/规范——互作网络图(布局+节点分层着色)、通路富集/拓扑图、机制示意图的结构化布局方案,节点用标准标识并附图例
怎么用
示例提问,比如「我有一组差异基因,帮我从 STRING 拉互作网络,按连接度给节点分层上色,别画成毛球,再配个图例」。触发后它会从基因集检索 Reactome/STRING 生成通路与网络,选合适布局并按度/模块分层着色,规范节点标识与边语义避免毛球化,还能帮你设计机制示意图的实体、箭头语义与层次,并给出可编辑的源便于微调。
提个醒
通路和互作关系都会溯源到数据库证据,不会凭空造节点或连边;示意图是概念表达,不会暗示未经验证的因果机制。