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规划质谱实验

Plan a Mass Spectrometry Experiment · 🔴专家 · 所属分类:实验室研究与实验方法

蛋白组、代谢组的样本制备、酶切、除盐和对照重复只要设计得不到位,样本还没上机数据质量就已经注定。它帮你把上机前的整套前端流程设计成可复现的方案,把命运握在样本制备阶段。

适合谁

要送蛋白组/PTM/代谢组/靶向定量样本、又想跟质谱平台顺畅对接的研究生和研究人员。

给它什么 · 得到什么

  • 你提供:样本类型与目的(蛋白组/PTM/代谢组/靶向定量)、样本量、可用质谱平台、定量策略需求与预算。
  • 你得到:一份质谱前端方案——样本制备与酶切流程、标记/无标记定量设计、对照与重复、QC 与上机沟通清单、下游分析衔接。

怎么用

可以说:「我要做 6 组细胞的定量蛋白组,纠结用 TMT 还是 label-free,帮我把样本制备到上机的方案理一遍。」它会按你的目的选 DDA/DIA/靶向和定量策略,设计裂解、还原烷基化、酶切和除盐流程,规划生物学/技术重复与对照,设好混合质控样、上机顺序、空白等 QC,并把下游分析要的元数据和格式一起对接清楚。

提个醒

它聚焦湿实验前端设计,实际上机采集和下游数据分析要与质谱平台及分析流程协同,替代不了平台自己的 SOP。