分析群体遗传数据
Analyze Population Genetics · 🔴专家 · 所属分类：组学与生物信息分析
你有一批群体的基因型数据，想弄清它们之间是怎么分化的、哪些区域可能被自然选择「改造」过。它带你规范地跑群体结构、分化和选择信号分析，更关键的是提醒你哪些结论是取样偏差或指标误用造出来的假象，不让你把「统计显著」轻易讲成一个漂亮的演化故事。
适合谁
做群体重测序、进化与生态基因组的研究生、PI，以及承接群体分析的生信工程师。
给它什么 · 得到什么
- 你提供：群体基因型数据（VCF/PLINK）、样本的群体标签与地理/分组信息、参考基因组，以及你想回答的问题（结构 / 分化 / 选择）
- 你得到：PCA、ADMIXTURE、Fst、π、Tajima's D、选择扫描等结果，配套可视化，以及方法与解读说明
怎么用
先说一句你真实的诉求，比如：
「这是我30个群体、每群约20个个体的重测序VCF，先帮我看整体群体结构，再在高海拔群体里扫一遍选择信号，顺便算各群体的Fst和π。」 触发后它会先和你确认分组与取样情况，按结构—分化—选择的顺序推进，评估K值稳健性、控制人口历史对选择扫描的混淆，最后给出图和一份带前提说明的解读。
提个醒
群体推断对取样和模型假设很敏感，统计信号不等于演化机制的定论；它会避免把群体结论用于给人群贴标签，通用红线同样适用。