提取放射组学特征
Extract Radiomics Features · 🔴专家 · 所属分类:生物成像与图像分析
放射组学特征动辄上千维,预处理不统一(重采样、离散化、归一化)会让特征漂移、跨中心不可比,踩了坑还难自查,结果发不出去。它帮你按 IBSI 标准对齐预处理,用 pyradiomics 稳定提取特征并留存参数,附上可复核的质控报告;要建深度学习模型时,它给你可复现脚手架而不代跑。
适合谁
做放射组学/影像组学研究的影像科研人员、医学影像方向研究生和相关数据分析者。
给它什么 · 得到什么
- 你提供:医学影像(DICOM/NIfTI,CT/MRI/PET,注明模态与体素间距)、对应的分割掩膜或 ROI、目标任务(特征提取或深度学习),以及 pyradiomics 参数意图(binWidth、重采样等)。
- 你得到:标准化放射组学特征矩阵、可复现提取脚本和质控报告;涉及深度学习时,只给可复现脚手架脚本,并显式声明需要你自己的 GPU 与数据。
怎么用
先抛一句示例提问:「我有一批肺结节 CT 和对应分割掩膜,想按 IBSI 提一阶、纹理和形状特征,binWidth 25,帮我搭一套可复现的 pyradiomics 提取脚本并做质控。」触发后它会统一重采样/强度归一化/离散化并对齐 IBSI,用 pyradiomics 提形状/一阶/纹理特征、留存参数,评估特征稳定性、冗余与批次可比性,必要时用 MONAI 搭训练/验证脚手架。
提个醒
它仅供研究、非诊断,不替代医生;特征提取遵循 IBSI 以保证可复核;深度学习部分是脚手架而不是成品模型。