分析细胞间通讯
Analyze Cell-Cell Communication · 🟡进阶 · 所属分类：组学与生物信息分析
你想从单细胞数据推断细胞之间的配受体通讯，但CellChat、CellPhoneDB、LIANA经常各说各话，配受体库版本或物种一错结论就全偏。它帮你统一物种和库版本、跨方法取共识，把「统计显著的预测」和「生物学上真实发生的互作」分开讲，给你一份需要湿实验验证的候选清单。
适合谁
研究肿瘤微环境、免疫互作、组织微环境的单细胞研究者与研究生。
给它什么 · 得到什么
- 你提供：已注释细胞类型的表达对象（h5ad/Seurat）、物种、分组信息，以及你关注的发送/接收细胞或通路
- 你得到：配受体互作打分表、通讯网络/热图/弦图，以及跨方法一致性说明和需验证的候选清单
怎么用
把注释好的数据交给它，比如：
「我这个已注释细胞类型的肿瘤微环境数据，想看看肿瘤细胞和T细胞之间有哪些配受体通讯，最好多个工具交叉验证。」 触发后它会封装CellChat/CellPhoneDB/LIANA并统一物种配受体库版本，计算细胞对间互作强度与显著性、做多方法共识过滤，按通路聚合出网络图和弦图，并标注这些仅为计算预测。
提个醒
结果是基于表达的统计预测，不是直接的互作证据；它必须匹配正确的物种配受体库，跨物种误用就会失效。